Le climat est de type subcontinental et pour l'essentiel montagnard. En hiver, il fait froid avec beaucoup de neige, tandis qu'en été il fait doux et orageux. Au mois d'avril et en octobre le temps est  plus sec. La pluviométrie du département est parmi la plus importante de France. Les reliefs de dénivelé ainsi que l'effet des versants donnent des températures variées. Le seul point commun est, l'amplitude thermique (continentale). Mais au bord du lac Léman les températures sont plus tempérées. Ainsi à Annecy, au mois de janvier la température moyenne est de 1°C tandis qu'au mois de juillet elle est de 20°C. Cela explique pourquoi on trouve des vignes dans cette région. L'enneigement est tout bonnement le meilleur de France. A 2000 mètres la neige persiste de mi octobre à mi-mai. Au dessus, c'est la formation des glaciers.